Il sistema “Galleria Lonato”, della lunghezza complessiva di 7.950 metri, comprende le trincee di approccio ed uscita, cui seguono le due gallerie artificiali e le singole canne della galleria naturale. La galleria naturale, a doppia canna a singolo binario, con una lunghezza complessiva di circa 4.800 metri è la più lunga di tutto il tracciato. Nel settembre del 2022 è stata realizzata la prima canna a singolo binario così come entrambi i sotto attraversamenti dell’autostrada A4. Lo scavo della galleria naturale Lonato è terminato nel febbraio del 2024 mentre sono in corso gli interventi di completamento dell’opera ferroviaria con la realizzazione dei bypass di sicurezza (gallerie di lunghezza di circa 20 metri che collegheranno le due canne), delle nicchie (vani adibiti agli impianti tecnologici) fino alla posa dell’armamento ferroviario e all’installazione della parte tecnologica.